1、更低的交易成本
小程序的成本远远低于传统的B2C商城，京东和天猫店主入驻一般需要支付多种费用，以京东、服装品类为例：
1)平台使用费，每月1000元;
2)保证金，3万元;
3)交易费率，每笔交易抽取7%～8%(FBP/SOP)，不同的品类费率不一样，天猫与京东也不同，但类似，开店成本高昂。
而在小程序上开商城，涉及到的费用通常只有两项：店铺建设/维护成本 微信支付的费率。
对于一个商家来说，他有足够的动力可以把老顾客的“重复购买”(例如30%)或者是老用户引导到小程序商城中，多出来的利润，算起来将会是一个很可观的数字。
2、交易盘子不输京东、天猫
去年，京东和天猫(不算淘宝)B2C业务的交易量，加起来不到两万亿。
未来，小程序商城的交易量，可能会占到这个盘子的三分之一，原因就在于小程序的交易成本远远低于传统电商。虽然这样说目前还为时尚早。不过我们不妨假定一下，如果这个判断成立，那么未来通过微信小程序的B2C交易量将超过六千亿，除掉微信分掉的0.6%，仍是非常大的市场体量。
3、与零售、O2O相比，小程序电商更加标准化
首先，行业内有足够多的人才，和经验积累，大家对于电商的了解比较深;第二，就是相对于零售和O2O这种线下服务来说，电商标准化程度更高，小程序渗透速度更快，电商企业可以借助微信的整个社交关系链进行传播。
4、交易环节优势明显
小程序之前，微信里的商城通常用H5制作，用户在次打开的时候一般比较慢，这一点跟小程序差不多。不过，在次打开之后，两者的体验差异就会显现出来。由于HTML5的网页属性，每次打开心的页面都需要重新加载，而小程序商城在次打开之后，体验会流畅不少。
小程序商城还有另一个优势，就是降低了重复购买的难度。如果你关掉HTML5商城，下次想找到就很难了，要么去翻过去的聊天记录，要么通过订阅号、服务号的菜单栏去找。而小程序用过之后，可以在历史菜单中找到，路径缩短了很多，转化率就会大不一样。
当然，相比HTML5商城，小程序的审核更为严格，H5商城一些用于营销的功能，如大转盘等，就可能无法通过审核，微信对小程序需要一一审核，保证小程序符合规范。
5、支付亮点多
小程序商城需要申请微信支付，现在申请微信支付需要营业执照，要么是企业，要么是个体商户，个人是无法申请的。而HTML5商城的支付接口一般是第三方的提供。
两种有不同的特点：
1)HTML5商城可能很多是个体微商，小程序商城只能是企业，小程序对客户的保障性更好;
2)HTML5商城交易完成后，钱先给到第三方平台，之后再分给商户，这中间可能有一定的时间间隔。而小程序是通过微信支付交易，交易完成后，钱直接到打商户的账户上(扣除微信0.6%的分成)。
账期相对更短，这相当于一个较大的升级。
6、流量来源更多样
在H5商城时代，真正做微商挣到钱的人无非两类：
(1)通过朋友圈做分销(甚至违法传销);
(2)大的自媒体/公众号。
前一类难免存在违规，或者是把熟人坑了一把。后者则多依赖大的自媒体/公众号。他们之所以可以从电商那里获益，原因在于它有源源不断的“一次性消费”流量，比如通过爆款文章、公众号底部tab，或者文章内的二维码，但用户一旦关掉，就很难再找到入口，很难产生重复购买。另外，也有些人会把用户引导到天猫、京东上来完成购买。
小程序现在提供了很多免费的流量入口，比如「好友」、「社群」、「附近的小程序」等，小程序与公众号的关联也更为，小程序嵌入公众号的方式也让用户的整个阅读体验不一样，交易流程也更为顺畅。