1、已经开始运行的鱼缸，已经有其它异养菌占据优势，如果想得到有益菌的利益必须按时重复投入菌种，成本和水质波动的维护都是问题，效果也差，所以需要用有益菌发酵创缸。
2、同时用两只小桶分别做两个简易气举，分别投三菌和味精，分别培养异养菌和自养菌，十二天到半个月后用培养好的环重新组装过滤，分别消毒桶，环，简易气举，还有其它将使用的物品。
3、分别投入味精和三菌，简易防尘，运行气举，连续运行半个月，培养硝化细菌最好能测试硝酸，二氧化氮，适时补充味精。
4、2毫升水，投入数滴酸奶，两片研碎的酵母片，二十分之一支妈咪爱，充分溶解后浸润饲料，再投喂，注意提高充氧能力，增加和改善过滤。
5、对于水质净化来说，本来就是以自然界的水体自净为原理的，只是我们强化了这个过程，并非是要完全丢弃对过滤系统的人为干扰，却也不能过于强掉我们希望达到的目的，必须在自然生态规律和人为因素之间寻找一个平衡点，才能在“生态”和“美”上获得最大的双赢，选择了被科学证实是完全无害的三菌，在驯化中帮助三菌占据优势地位，可以使有机物的分解效率大为提高。首先看到的是观赏性得到大幅度的改善，其次，三菌利用垃圾繁衍的同时分泌益菌素，维生素乙等，对维持鱼的健康也有辅助保健作用。
6、还有硝化细菌的效率，在自然开缸的鱼缸里可能不稳定，现在有“高手”还在定期补充硝化细菌，原因就是有机物残留，抑制硝化细菌的繁衍。由于使用了三菌驯化创缸，有机物残留就非常少，就给硝化细菌创造了更优良的生存空间，硝化效率可以长期稳定了，使用三菌驯化创缸后，日常维护变的简单了，例如滤棉，可以两三个月不用打理，不会堵塞。
7、应当注意的是，每周换水四到三分之一，稀释累积起来的磷酸盐，硝酸盐，以避免藻害和影响鱼的健康。千万不可因为水清澈就不换水。